在堆肥過程中，通風(fēng)有供氧，散熱和去除水分作用，通風(fēng)控制在很大程度上取決于空氣的供給方式①翻堆（自然通風(fēng)）②強(qiáng)制通風(fēng)，有正壓鼓風(fēng)、負(fù)壓抽風(fēng)和由正壓鼓風(fēng)與負(fù)壓抽風(fēng)組成的混合通風(fēng)；③翻堆與強(qiáng)制通風(fēng)的結(jié)合方式；④被動通風(fēng).因熱氣上升引起的"煙囪效應(yīng)"使空氣通過堆體的方式稱為被動通風(fēng)方式,應(yīng)用此通風(fēng)方式的堆肥系統(tǒng)稱為被動通風(fēng)條垛系統(tǒng),如圖1,穿孔管的孔朝上，它不需要翻堆和強(qiáng)制通風(fēng)，所以同條垛和強(qiáng)制通風(fēng)靜態(tài)垛系統(tǒng)相比，它大大地降低了投資和運(yùn)行費(fèi)用。自然通風(fēng)和被動通風(fēng)常用于條垛系統(tǒng)，強(qiáng)制通風(fēng)靜態(tài)垛系統(tǒng)和反應(yīng)器系統(tǒng)均采用強(qiáng)制通風(fēng)。在不同的堆肥階段，條垛系統(tǒng)翻堆的頻率不同，需根據(jù)具體情況而定，通常采用溫度作為是否翻堆的標(biāo)志（堆體中心溫度為55或60℃）.如用稻草、谷殼、干草、干樹葉、木片或鋸屑作調(diào)整劑且與污泥形成的混合物的含水率約為60%，堆體建好后第3天翻堆，然后每隔一天翻堆一次直至第4次，從第4次翻堆后，每隔4或5天翻堆一次。如果用廢紙做調(diào)理劑，只要污泥混合物含水率不超過50%，便可如下頻率進(jìn)行翻堆.
不同的通風(fēng)方式對堆肥過程有不同的影響,采用自然通風(fēng)(翻堆)、被動通風(fēng)和強(qiáng)制通風(fēng)對豬糞（含水率高達(dá)76%）堆肥研究表明：在被動通風(fēng)和強(qiáng)制通風(fēng)下，堆溫下降較快，但它們能更有效地向堆體供氧；而在被動通風(fēng)和自然通風(fēng)方式下。堆體中心溫度＞55℃的時間較長.同其它通風(fēng)方式相比,強(qiáng)制通風(fēng)易于操作和控制,并且是為堆料生物降解提供氧氣的最有效方法,然而它對通風(fēng)管附近的堆料有明顯的冷卻效應(yīng)。